Pada tahun Cosmic Era 0071, perkelahian antara dua mobile suit di masa perang mengakibatkan kehancuran negara netral. Shinn Asuka menemukan seluruh keluarganya terbunuh sebagai korban kekerasan, dan bersumpah hidupnya untuk membalas dendam terhadap kekuatan Alam Bumi, dengan kesan bahwa merekalah yang bertanggung jawab atas kematian keluarganya. Shinn bekerja keras melalui pasukan militer ZAFT, dan akhirnya mendapatkan akses ke kokpit prototipe mobile suit Impulse.

Athrun Zala, seorang veteran perang baru-baru ini yang bekerja untuk diplomat Cagalli Yula Athha, menemukan dirinya terseret ke dalam konflik baru antara para Naturals dan para Koordinator: manusia yang secara artifisial ditingkatkan sebelum lahir dan dibenci oleh para Naturals karena keuntungan biologis mereka.

Saat perang baru muncul dan kekerasan menjadi tak terelakkan, Athrun mendapati dirinya sendiri sebagai mentor bagi Shinn yang pahit. Athrun harus mengarahkan pilot muda itu menuju pola pikir belas kasihan sebelum amarah dan keinginan balas dendam menghabisinya.

[Ditulis oleh MAL Rewrite]

Catatan: Sinopsis diterjemahkan secara otomatis oleh Google Translate.