Lima belas tahun setelah peristiwa bencana yang dikenal sebagai Dampak Kedua, dunia menghadapi ancaman baru: makhluk surgawi mengerikan yang disebut "Malaikat" menyerang Tokyo-3 satu per satu. Umat ​​manusia tidak dapat mempertahankan diri melawan Malaikat meskipun menggunakan amunisi dan taktik militer mereka yang paling canggih.

Satu-satunya harapan untuk keselamatan manusia terletak di tangan NERV, sebuah organisasi misterius yang dipimpin oleh Gendou Ikari yang dingin. NERV mengoperasikan robot humanoid raksasa yang dijuluki "Evangelions" untuk memerangi Malaikat dengan persenjataan canggih dan penghalang pelindung yang dikenal sebagai Lapangan Teror Absolut.

Bertahun-tahun setelah ditinggalkan oleh ayahnya, Shinji Ikari, putra Gendou yang berusia 14 tahun, kembali ke Tokyo-3. Shinji mengalami pertempuran internal terus-menerus melawan trauma terkubur yang disebabkan oleh kehilangan ibunya dan pengabaian emosional yang dideritanya di tangan ayahnya.

Ketakutan untuk membuka diri terhadap orang lain, kehidupan Shinji selamanya berubah setelah bertemu dengan Misato Katsuragi yang berusia 29 tahun, seorang perwira NERV berpangkat tinggi yang menunjukkan kepadanya kebaikan ibu berjiwa bebas yang belum pernah dia alami. Serangan Malaikat yang menghancurkan memaksa Shinji beraksi saat Gendou mengungkapkan motif sebenarnya untuk mengundang putranya kembali ke Tokyo-3: Shinji adalah satu-satunya anak yang mampu mengemudikan Evangelion Unit-01 secara efisien, robot baru yang disinkronkan dengan biometriknya.

Terlepas dari trauma psikologis brutal yang ditimbulkan oleh mengemudikan Evangelion, Shinji membela Tokyo-3 dari ancaman malaikat, tidak menyadari intrik gelap ayahnya. [Ditulis oleh MAL Penulisan Ulang]

Catatan: Sinopsis diterjemahkan secara otomatis oleh Google Translate.